11 月 11 日,Google DeepMind 发布新一代基因组模型 AlphaGenome 2。它把对 DNA 序列及其变异的预测,从组织平均层面推进到单个细胞类型与细胞状态层面,帮助研究者定位哪些遗传变异在特定细胞里推动疾病。

前代 AlphaGenome 按整块组织做笼统预测,同一组织内混合的数十种细胞会把关键信号平均掉。AlphaGenome 2 改为条件模型:在百万字母 DNA 序列之外,额外输入目标细胞类型或细胞状态,针对单一条件定向推理,并支持跨模态补全缺失实验数据。

训练数据覆盖 68 种组织、超过 1.07 亿个单细胞图谱(人 + 鼠)。在含 28 种原代免疫细胞的 TenK10K 测试上,AlphaGenome 2 识别致病因果变异的比例达 30%,上代经微调后为 16%;判断基因表达变化方向的准确率为 43%,对比基线 23%,整体近两倍提升。

除基因表达外,它还能预测组蛋白修饰、染色质可及性与 DNA 甲基化,并可在不重新训练的情况下分析未见过的细胞状态。模型现已通过 AlphaGenome API 向非商业研究开放,商业研究处于私有预览;DeepMind 将把模型封装为 Skills,接入代理式开发平台 Google Antigravity,与 Gemini 4 协同加速科研。

AlphaGenome 2:把基因变异预测推到单细胞分辨率11 月 11 日发布 · 条件模型架构,按细胞类型/状态定向推理训练数据覆盖 68 种组织,超 1.07 亿个单细胞图谱(人 + 鼠)前代按整块组织取平均,关键细胞信号被掩盖TenK10K 基准(28 种原代免疫细胞)因果变异识别:30% vs 上代 16%(近 2 倍)方向性基因效应:43% vs 上代 23%新增能力DNA 甲基化预测(上代不支持)跨模态补全缺失实验;未见细胞状态免微调可用性与落地AlphaGenome API 非商业开放;商业私有预览将封装为 Skills 接入 Google Antigravity(Gemini 4)L1=DeepMind 官方博客 11-11 · L2=36氪/腾讯新闻 11-12
AlphaGenome 2:从组织平均到单细胞分辨率的基因变异预测

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